13 (25) апреля 1879 г. С.-Петербургская городская управа утвердила разработанный Д. В. Люшиным проект флигеля Духовной семинарии, предназначенный для размещения больницы. Здание было возведено в 1879—1881 гг. Т-образное, разновысотное здание (1 и 2 этажа) было обращено большей плоскостью к семинарскому зданию. В нем были устроены 4 палаты и 9 служебных помещений.

20 октября 1893 г. был рассмотрен и утвержден проект В. М. Елкашева по устройству каменной одноэтажной пристройки с севера к двухэтажной части. Одновременно была несколько расширена площадь второго этажа и сооружен крытый переход от нового церковного Семинарии к больнице.

В 1906—1907 гг. по проекту гражданского инженера Е. Л. Морозова была сделана полная перестройка здания. Его высота по всей площади была поднята до трех этажей. При этом здание было расширено с северной стороны.

После закрытия 30 сентября 1918 г. Духовной семинарии, здание использовалось под различные нужды. В 1944 г. в нем находилась часть общежития ведомства Ленэнерго.

Духовным школам корпус окончательно был передан к 1988 г., и в нем были размещены жилые помещения для преподавательского состава.